Procedimento necessário para que uma aplicação web rode em servidor IIS é:

1. Executar o prompt: Executar-> cmd
2. Achar o diretório: CD.. até chegar ao C:(voltando) e CD até chegar a o caminho completo "C:\WINDOWS\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727"
3. Digite o executavel: "aspnet_regiis.exe -i" terminando com Enter.

Pronto, agora aguarde a instalação.

Essas passos são válidos para todas as versões do Framework .NET é necessário apenas mudar a ultima pasta com a versão ao qual se quer instalar.